You can not select more than 25 topics Topics must start with a letter or number, can include dashes ('-') and can be up to 35 characters long.

12 KiB

Vizualizacija odnosa: Sve o medu 🍯

 Sketchnote by (@sketchthedocs)
Vizualizacija odnosa - Sketchnote by @nitya

Nastavljajući s prirodnim fokusom našeg istraživanja, istražimo zanimljive vizualizacije koje prikazuju odnose između različitih vrsta meda, prema skupu podataka dobivenom od Ministarstva poljoprivrede Sjedinjenih Država.

Ovaj skup podataka sadrži oko 600 stavki i prikazuje proizvodnju meda u mnogim američkim saveznim državama. Na primjer, možete pogledati broj kolonija, prinos po koloniji, ukupnu proizvodnju, zalihe, cijenu po funti i vrijednost proizvedenog meda u određenoj državi od 1998. do 2012., s jednim redom po godini za svaku državu.

Bilo bi zanimljivo vizualizirati odnos između proizvodnje određene države po godini i, na primjer, cijene meda u toj državi. Alternativno, mogli biste vizualizirati odnos između prinosa meda po koloniji u različitim državama. Ovo vremensko razdoblje obuhvaća razorni fenomen 'CCD' ili 'Sindrom kolapsa kolonija', prvi put zabilježen 2006. godine (http://npic.orst.edu/envir/ccd.html), što čini ovaj skup podataka posebno značajnim za proučavanje. 🐝

Kviz prije predavanja

U ovoj lekciji možete koristiti Seaborn, biblioteku koju ste već koristili, kao odličan alat za vizualizaciju odnosa između varijabli. Posebno je zanimljiva funkcija relplot u Seabornu, koja omogućuje scatter plotove i linijske grafove za brzu vizualizaciju 'statističkih odnosa', što pomaže znanstvenicima u podacima da bolje razumiju kako su varijable međusobno povezane.

Scatterplotovi

Koristite scatterplot za prikaz kako se cijena meda razvijala iz godine u godinu, po državama. Seaborn, koristeći relplot, praktično grupira podatke po državama i prikazuje točke za kategorijske i numeričke podatke.

Započnimo uvozom podataka i biblioteke Seaborn:

import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
honey = pd.read_csv('../../data/honey.csv')
honey.head()

Primijetit ćete da podaci o medu sadrže nekoliko zanimljivih stupaca, uključujući godinu i cijenu po funti. Istražimo ove podatke grupirane po američkim državama:

država brojkol prinospokol ukupnaprod zalihe cijenapofunti vrijednostprod godina
AL 16000 71 1136000 159000 0.72 818000 1998
AZ 55000 60 3300000 1485000 0.64 2112000 1998
AR 53000 65 3445000 1688000 0.59 2033000 1998
CA 450000 83 37350000 12326000 0.62 23157000 1998
CO 27000 72 1944000 1594000 0.7 1361000 1998

Napravite osnovni scatterplot za prikaz odnosa između cijene po funti meda i države podrijetla. Postavite y os dovoljno visoko da prikaže sve države:

sns.relplot(x="priceperlb", y="state", data=honey, height=15, aspect=.5);

scatterplot 1

Sada prikažite iste podatke s paletom boja inspiriranom medom kako biste pokazali kako se cijena mijenja tijekom godina. To možete učiniti dodavanjem parametra 'hue' za prikaz promjena iz godine u godinu:

Saznajte više o paletama boja koje možete koristiti u Seabornu - isprobajte prekrasnu paletu boja poput duge!

sns.relplot(x="priceperlb", y="state", hue="year", palette="YlOrBr", data=honey, height=15, aspect=.5);

scatterplot 2

S ovom promjenom palete boja možete jasno vidjeti snažan napredak tijekom godina u pogledu cijene meda po funti. Ako pogledate uzorak podataka za provjeru (na primjer, odaberite državu Arizonu), možete uočiti obrazac povećanja cijene iz godine u godinu, uz nekoliko iznimaka:

država brojkol prinospokol ukupnaprod zalihe cijenapofunti vrijednostprod godina
AZ 55000 60 3300000 1485000 0.64 2112000 1998
AZ 52000 62 3224000 1548000 0.62 1999000 1999
AZ 40000 59 2360000 1322000 0.73 1723000 2000
AZ 43000 59 2537000 1142000 0.72 1827000 2001
AZ 38000 63 2394000 1197000 1.08 2586000 2002
AZ 35000 72 2520000 983000 1.34 3377000 2003
AZ 32000 55 1760000 774000 1.11 1954000 2004
AZ 36000 50 1800000 720000 1.04 1872000 2005
AZ 30000 65 1950000 839000 0.91 1775000 2006
AZ 30000 64 1920000 902000 1.26 2419000 2007
AZ 25000 64 1600000 336000 1.26 2016000 2008
AZ 20000 52 1040000 562000 1.45 1508000 2009
AZ 24000 77 1848000 665000 1.52 2809000 2010
AZ 23000 53 1219000 427000 1.55 1889000 2011
AZ 22000 46 1012000 253000 1.79 1811000 2012

Drugi način za vizualizaciju ovog napretka je korištenje veličine umjesto boje. Za korisnike s poteškoćama u razlikovanju boja, ovo bi mogla biti bolja opcija. Uredite svoju vizualizaciju tako da povećanje cijene prikažete povećanjem opsega točaka:

sns.relplot(x="priceperlb", y="state", size="year", data=honey, height=15, aspect=.5);

Možete vidjeti kako se veličina točaka postupno povećava.

scatterplot 3

Je li ovo jednostavan slučaj ponude i potražnje? Zbog čimbenika poput klimatskih promjena i kolapsa kolonija, je li dostupno manje meda za kupnju iz godine u godinu, pa cijena raste?

Kako bismo otkrili korelaciju između nekih varijabli u ovom skupu podataka, istražimo nekoliko linijskih grafova.

Linijski grafovi

Pitanje: Postoji li jasan porast cijene meda po funti iz godine u godinu? To možete najlakše otkriti stvaranjem jednostavnog linijskog grafa:

sns.relplot(x="year", y="priceperlb", kind="line", data=honey);

Odgovor: Da, uz nekoliko iznimaka oko 2003. godine:

line chart 1

Budući da Seaborn agregira podatke u jednu liniju, prikazuje "više mjerenja za svaku vrijednost x tako što crta srednju vrijednost i interval pouzdanosti od 95% oko srednje vrijednosti". Izvor. Ovo ponašanje koje oduzima vrijeme može se onemogućiti dodavanjem ci=None.

Pitanje: Pa, možemo li također vidjeti porast u opskrbi medom oko 2003. godine? Što ako pogledate ukupnu proizvodnju iz godine u godinu?

sns.relplot(x="year", y="totalprod", kind="line", data=honey);

line chart 2

Odgovor: Ne baš. Ako pogledate ukupnu proizvodnju, čini se da je zapravo porasla te godine, iako općenito količina proizvedenog meda opada tijekom tih godina.

Pitanje: U tom slučaju, što je moglo uzrokovati taj skok u cijeni meda oko 2003. godine?

Kako bismo to otkrili, možemo istražiti facet grid.

Facet gridovi

Facet gridovi uzimaju jedan aspekt vašeg skupa podataka (u našem slučaju, možete odabrati 'godinu' kako biste izbjegli previše proizvedenih gridova). Seaborn tada može napraviti graf za svaki od tih aspekata vaših odabranih x i y koordinata za lakšu vizualnu usporedbu. Ističe li se 2003. godina u ovoj vrsti usporedbe?

Napravite facet grid koristeći relplot, kako preporučuje dokumentacija za Seaborn.

sns.relplot(
    data=honey, 
    x="yieldpercol", y="numcol",
    col="year", 
    col_wrap=3,
    kind="line"
    )

U ovoj vizualizaciji možete usporediti prinos po koloniji i broj kolonija iz godine u godinu, usporedno s postavkom wrap na 3 za stupce:

facet grid

Za ovaj skup podataka, ništa posebno ne iskače u vezi s brojem kolonija i njihovim prinosom, iz godine u godinu i iz države u državu. Postoji li drugačiji način za pronalaženje korelacije između ove dvije varijable?

Dvostruki linijski grafovi

Isprobajte višelinijski graf superponiranjem dvaju linijskih grafova jedan na drugi, koristeći Seabornov 'despine' za uklanjanje gornjih i desnih osi, te koristeći ax.twinx iz Matplotliba. Twinx omogućuje dijagramu dijeljenje x osi i prikaz dviju y osi. Dakle, prikažite prinos po koloniji i broj kolonija, superponirano:

fig, ax = plt.subplots(figsize=(12,6))
lineplot = sns.lineplot(x=honey['year'], y=honey['numcol'], data=honey, 
                        label = 'Number of bee colonies', legend=False)
sns.despine()
plt.ylabel('# colonies')
plt.title('Honey Production Year over Year');

ax2 = ax.twinx()
lineplot2 = sns.lineplot(x=honey['year'], y=honey['yieldpercol'], ax=ax2, color="r", 
                         label ='Yield per colony', legend=False) 
sns.despine(right=False)
plt.ylabel('colony yield')
ax.figure.legend();

superimposed plots

Iako ništa posebno ne iskače oko 2003. godine, ovo nam omogućuje da završimo lekciju na malo sretnijoj noti: iako općenito dolazi do smanjenja broja kolonija, broj kolonija se stabilizira čak i ako njihov prinos po koloniji opada.

Naprijed, pčele! 🐝❤️

🚀 Izazov

U ovoj lekciji naučili ste nešto više o drugim načinima korištenja scatterplotova i linijskih gridova, uključujući facet gridove. Izazovite se da napravite facet grid koristeći neki drugi skup podataka, možda onaj koji ste koristili prije ovih lekcija. Obratite pažnju na to koliko dugo traje njihovo stvaranje i koliko pažljivo trebate biti s brojem gridova koje trebate nacrtati koristeći ove tehnike.

Kviz nakon predavanja

Pregled i samostalno učenje

Linijski grafovi mogu biti jednostavni ili prilično složeni. Pročitajte malo više u dokumentaciji za Seaborn o raznim načinima na koje ih možete izgraditi. Pokušajte unaprijediti linijske grafove koje ste izradili u ovoj lekciji koristeći druge metode navedene u dokumentaciji.

Zadatak

Zaronite u košnicu


Odricanje od odgovornosti:
Ovaj dokument je preveden korištenjem AI usluge za prevođenje Co-op Translator. Iako nastojimo osigurati točnost, imajte na umu da automatski prijevodi mogu sadržavati pogreške ili netočnosti. Izvorni dokument na izvornom jeziku treba smatrati mjerodavnim izvorom. Za ključne informacije preporučuje se profesionalni prijevod od strane stručnjaka. Ne preuzimamo odgovornost za bilo kakva nesporazuma ili pogrešna tumačenja koja mogu proizaći iz korištenja ovog prijevoda.