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視覺化關係:蜂蜜的故事 🍯

 Sketchnote by (@sketchthedocs)
視覺化關係 - Sketchnote by @nitya

延續我們研究的自然主題,讓我們探索一些有趣的視覺化方式,來展示不同種類蜂蜜之間的關係。這些數據集來自美國農業部

這個包含約600項的數據集展示了美國多個州的蜂蜜生產情況。例如您可以查看每個州在1998年至2012年間的蜂群數量、每群產量、總產量、庫存、每磅價格以及蜂蜜的生產價值每年每州一行數據。

我們可以視覺化某州每年的生產量與該州蜂蜜價格之間的關係。或者您也可以視覺化各州每群蜂蜜產量之間的關係。這段時間涵蓋了2006年首次出現的毀滅性「蜂群崩潰症候群 (CCD)」(http://npic.orst.edu/envir/ccd.html因此這是一個值得研究的數據集。🐝

課前測驗

在本課中,您可以使用之前使用過的 Seaborn 庫,這是一個很好的工具來視覺化變數之間的關係。特別有趣的是使用 Seaborn 的 relplot 函數,它可以快速生成散點圖和折線圖,視覺化「統計關係」,幫助數據科學家更好地理解變數之間的關聯。

散點圖

使用散點圖展示蜂蜜價格如何隨年份在各州演變。Seaborn 的 relplot 可以方便地將州的數據分組,並顯示分類和數值數據的數據點。

首先,導入數據和 Seaborn

import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
honey = pd.read_csv('../../data/honey.csv')
honey.head()

您會注意到蜂蜜數據中有幾個有趣的列,包括年份和每磅價格。讓我們按美國州分組來探索這些數據:

蜂群數量 每群產量 總產量 庫存 每磅價格 生產價值 年份
AL 16000 71 1136000 159000 0.72 818000 1998
AZ 55000 60 3300000 1485000 0.64 2112000 1998
AR 53000 65 3445000 1688000 0.59 2033000 1998
CA 450000 83 37350000 12326000 0.62 23157000 1998
CO 27000 72 1944000 1594000 0.7 1361000 1998

創建一個基本的散點圖,展示每磅蜂蜜價格與其來源州之間的關係。讓 y 軸足夠高以顯示所有州:

sns.relplot(x="priceperlb", y="state", data=honey, height=15, aspect=.5);

scatterplot 1

接下來,使用蜂蜜色系展示價格如何隨年份演變。您可以通過添加 'hue' 參數來顯示年份的變化:

了解更多關於 Seaborn 可用的色彩調色板 - 試試美麗的彩虹色系!

sns.relplot(x="priceperlb", y="state", hue="year", palette="YlOrBr", data=honey, height=15, aspect=.5);

scatterplot 2

使用這種色彩方案,您可以清楚地看到蜂蜜每磅價格在多年來的明顯增長趨勢。事實上,如果您查看數據中的樣本集(例如選擇一個州,亞利桑那州),您會發現價格每年都有增長,只有少數例外:

蜂群數量 每群產量 總產量 庫存 每磅價格 生產價值 年份
AZ 55000 60 3300000 1485000 0.64 2112000 1998
AZ 52000 62 3224000 1548000 0.62 1999000 1999
AZ 40000 59 2360000 1322000 0.73 1723000 2000
AZ 43000 59 2537000 1142000 0.72 1827000 2001
AZ 38000 63 2394000 1197000 1.08 2586000 2002
AZ 35000 72 2520000 983000 1.34 3377000 2003
AZ 32000 55 1760000 774000 1.11 1954000 2004
AZ 36000 50 1800000 720000 1.04 1872000 2005
AZ 30000 65 1950000 839000 0.91 1775000 2006
AZ 30000 64 1920000 902000 1.26 2419000 2007
AZ 25000 64 1600000 336000 1.26 2016000 2008
AZ 20000 52 1040000 562000 1.45 1508000 2009
AZ 24000 77 1848000 665000 1.52 2809000 2010
AZ 23000 53 1219000 427000 1.55 1889000 2011
AZ 22000 46 1012000 253000 1.79 1811000 2012

另一種視覺化這種進展的方法是使用大小而非顏色。對於色盲用戶,這可能是一個更好的選擇。編輯您的視覺化,通過點的圓周大小來展示價格的增長:

sns.relplot(x="priceperlb", y="state", size="year", data=honey, height=15, aspect=.5);

您可以看到點的大小逐漸增大。

scatterplot 3

這是否只是供需的簡單案例?由於氣候變化和蜂群崩潰等因素,是否每年可供購買的蜂蜜減少,因此價格上漲?

為了探索數據集中某些變數之間的相關性,讓我們來看看一些折線圖。

折線圖

問題:蜂蜜每磅價格是否每年都有明顯上漲?您可以通過創建一個單一折線圖來最容易地發現這一點:

sns.relplot(x="year", y="priceperlb", kind="line", data=honey);

答案是的除了2003年左右有一些例外

line chart 1

由於 Seaborn 將數據聚合到一條線上它通過繪製均值和均值周圍的95%置信區間來顯示「每個 x 值的多個測量值」。來源。這種耗時的行為可以通過添加 ci=None 禁用。

問題那麼在2003年我們是否也能看到蜂蜜供應的激增如果您查看每年的總產量呢

sns.relplot(x="year", y="totalprod", kind="line", data=honey);

line chart 2

答案:並不完全。如果您查看總產量,實際上在那一年似乎有所增加,儘管總體而言,蜂蜜的生產量在這些年中呈下降趨勢。

問題在這種情況下2003年蜂蜜價格的激增可能是什麼原因

為了探索這一點,您可以使用 Facet Grid。

Facet Grids

Facet Grid 可以選擇數據集的一個面在我們的例子中您可以選擇「年份」以避免生成過多的面。Seaborn 可以為您選擇的 x 和 y 坐標生成每個面的圖表方便比較。2003年是否在這種比較中顯得突出

繼續使用 Seaborn 的 relplot 創建 Facet Grid正如 Seaborn 文檔 所推薦的。

sns.relplot(
    data=honey, 
    x="yieldpercol", y="numcol",
    col="year", 
    col_wrap=3,
    kind="line"
    )

在這個視覺化中您可以比較每年的每群產量和蜂群數量並將列的包裹設置為3

facet grid

對於這個數據集,關於蜂群數量和每群產量,按年份和州比較並沒有特別突出的地方。是否有其他方式來尋找這兩個變數之間的相關性?

雙折線圖

嘗試使用多折線圖,通過將兩個折線圖疊加在一起,使用 Seaborn 的 'despine' 移除其上方和右側的框架,並使用 ax.twinx 源自 Matplotlib。Twins 允許圖表共享 x 軸並顯示兩個 y 軸。因此,疊加顯示每群產量和蜂群數量:

fig, ax = plt.subplots(figsize=(12,6))
lineplot = sns.lineplot(x=honey['year'], y=honey['numcol'], data=honey, 
                        label = 'Number of bee colonies', legend=False)
sns.despine()
plt.ylabel('# colonies')
plt.title('Honey Production Year over Year');

ax2 = ax.twinx()
lineplot2 = sns.lineplot(x=honey['year'], y=honey['yieldpercol'], ax=ax2, color="r", 
                         label ='Yield per colony', legend=False) 
sns.despine(right=False)
plt.ylabel('colony yield')
ax.figure.legend();

superimposed plots

雖然在2003年沒有明顯的異常但這讓我們以一個稍微樂觀的結論結束這節課儘管蜂群數量總體上在下降但蜂群數量正在穩定即使每群產量在減少。

加油,蜜蜂們,加油!

🐝❤️

🚀 挑戰

在本課中,您學到了更多關於散點圖和折線圖,包括 Facet Grid 的其他用途。挑戰自己使用不同的數據集創建 Facet Grid也許是您之前使用過的數據集。注意它們的生成時間以及如何小心選擇需要繪製的網格數量。

課後測驗

回顧與自學

折線圖可以很簡單,也可以非常複雜。閱讀 Seaborn 文檔 中的各種構建方法。嘗試使用文檔中列出的其他方法來增強您在本課中構建的折線圖。

作業

深入蜂巢


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